Publications HAL

2016

Journal articles

titre
Modelling survival: exposure pattern, species sensitivity and uncertainty
auteur
R. Ashauer, C. Albert, S. Augustine, N. Cedergreen, Sandrine Charles, V. Ducrot, A. Focks, F. Gabsi, A. Gergs, B. Goussen, T. Jager, N. I. Kramer, A. M. Nyman, V. Poulsen, S. Reichenberger, R. B. Schafer, P. J. van Den Brink, K. Veltman, S. Vogel, E. I. Zimmer, T. G. Preuss
article
Scientific Reports, 2016, 6, pp.29178. ⟨10.1038/srep29178⟩
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https://univ-lyon1.hal.science/hal-02016394/file/srep29178.pdf BibTex
titre
Optimal choice among a class of nonparametric estimators of the jump rate for piecewise-deterministic Markov processes
auteur
Romain Azaïs, Aurélie Muller-Gueudin
article
Electronic Journal of Statistics , 2016, 10 (2), pp.3648-3692. ⟨10.1214/16-EJS1207⟩
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https://hal.science/hal-01168651/file/paper.pdf BibTex
titre
Learning Discriminative Tree Edit Similarities for Linear Classification - Application to Melody Recognition
auteur
Aurélien Bellet, José F. Bernabeu, Amaury Habrard, Marc Sebban
article
Neurocomputing, 2016, 214, pp.155-161. ⟨10.1016/j.neucom.2016.06.006⟩
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https://hal.science/hal-01330492/file/ldTree2015.pdf BibTex
titre
Model-Based Clustering of Multivariate Ordinal Data Relying on a Stochastic Binary Search Algorithm
auteur
Christophe Biernacki, Julien Jacques
article
Statistics and Computing, 2016, 26 (5), pp.929-943. ⟨10.1007/s11222-015-9585-2⟩
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https://inria.hal.science/hal-01052447/file/Biernacki-Jacques-OrdinalDataModel.pdf BibTex
titre
A Kalman filter adapted to the estimation of mean gradients in the large-eddy simulation of unsteady turbulent flows
auteur
Jérôme Boudet, Emmanuel Lévêque, Pierre Borgnat, Adrien Cahuzac, Marc C. Jacob
article
Computers and Fluids, 2016, 127, pp.65-77. ⟨10.1016/j.compfluid.2015.12.006⟩
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https://hal.science/hal-01393342/file/Boudet_24073.pdf BibTex
titre
Optimizing the design of a reproduction toxicity test with the pond snail Lymnaea stagnalis
auteur
Sandrine Charles, Virginie Ducrot, Didier Azam, Rachel Benstead, Denise Brettschneider, Karel de Schamphelaere, Sandra Filipe Goncalves, John W. Green, Henrik Holbech, Thomas H. Hutchinson, Daniel Faber, Filipe Laranjeiro, Peter Matthiessen, Leif Norrgren, Jörg Oehlmann, Evelyn Reategui-Zirena, Anne Seeland-Fremer, Matthias Teigeler, Jean-Pierre Thomé, Marysia Tobor Kaplon, Lennart Weltje, Laurent Lagadic
article
Regulatory Toxicology and Pharmacology, 2016, 81, pp.47-56. ⟨10.1016/j.yrtph.2016.07.012⟩
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BibTex
titre
Dimension-free Concentration Bounds on Hankel Matrices for Spectral Learning
auteur
François Denis, Mattias Gybels, Amaury Habrard
article
Journal of Machine Learning Research, 2016, 17 (31), pp.1-32
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https://hal.science/hal-01306915/file/14-501.pdf BibTex
titre
A combinatorial approach to a model of constrained random walkers
auteur
Thibault Espinasse, Nadine Guillotin-Plantard, Philippe Nadeau
article
Combinatorics, Probability and Computing, 2016, 25 (2), pp.222-235
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https://hal.science/hal-00950845/file/prisoners-210214.pdf BibTex
titre
A Kriging procedure for processes indexed by graphs
auteur
Thibault Espinasse, Jean-Michel Loubes
article
Statistical Inference for Stochastic Processes, 2016, 19 (2), pp.159-173. ⟨10.1007/s11203-015-9128-7⟩
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https://hal.science/hal-01014022/file/kriging_6.pdf BibTex
titre
Extraction of Temporal Network Structures from Graph-based Signals
auteur
Ronan Hamon, Pierre Borgnat, Patrick Flandrin, Céline Robardet
article
IEEE Transactions on Signal and Information Processing over Networks, 2016, 2 (2), pp.215-226. ⟨10.1109/TSIPN.2016.2530562⟩
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https://hal.science/hal-01330184/file/TSIPN2530562.pdf BibTex
titre
Relabelling vertices according to the network structure by minimizing the cyclic bandwidth sum
auteur
Ronan Hamon, Pierre Borgnat, Patrick Flandrin, Céline Robardet
article
Journal of Complex Networks, 2016, 4 (4), pp. 534-560. ⟨10.1093/comnet/cnw006⟩
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titre
Correcting gene expression data when neither the unwanted variation nor the factor of interest are observed
auteur
Laurent Jacob, J. A. Gagnon-Bartsch, T. P. Speed
article
Biostatistics, 2016, 17, pp.16-28. ⟨10.1093/biostatistics/kxv026⟩
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titre
Model-based co-clustering for hyperspectral images
auteur
Julien Jacques, Cyril Ruckebusch
article
Journal of Spectral Imaging, 2016, 5, pp.a3-1 - a3-6. ⟨10.1255/jsi.2016.a3⟩
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https://hal.science/hal-01367941/file/Coclustering4HSI.pdf BibTex
titre
On the Complexity of Best Arm Identification in Multi-Armed Bandit Models
auteur
Emilie Kaufmann, Olivier Cappé, Aurélien Garivier
article
Journal of Machine Learning Research, 2016, 17, pp.1-42
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https://hal.science/hal-01024894/file/kaufman15a.pdf BibTex
titre
Bregman superquantiles. Estimation methods and applications.
auteur
Tatiana Labopin-Richard, Fabrice Gamboa, Aurélien Garivier, Bertrand Iooss
article
Dependence Modeling, 2016, 4 (1), pp.1-33
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https://hal.science/hal-00996440/file/ReviewedBregmanSuperquantile.pdf BibTex
titre
Mechanistic modelling of daphnid-algae dynamics within a laboratory microcosm
auteur
Dominique Lamonica, Ulysse Herbach, Frédéric Orias, Bernard Clément, Sandrine Charles, Christelle Lopes
article
Ecological Modelling, 2016, 320, pp.213-230. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2015.09.020⟩
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BibTex
titre
Modelling algae-duckweed interaction under chemical pressure within a laboratory microcosm
auteur
Dominique Lamonica, Bernard Clement, Sandrine Charles, Christelle Lopes
article
Ecotoxicology and Environmental Safety, 2016, 128, pp.252-65. ⟨10.1016/j.ecoenv.2016.02.008⟩
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BibTex
titre
Pour une étude de la dynamique du sens : réflexions épistémologiques sur la mémétique et l’épidémiologie des représentations
auteur
Sébastien Lerique
article
Travaux de Linguistique : Revue Internationale de Linguistique Française, 2016, 73 (2), pp.45-68. ⟨10.3917/tl.073.0045⟩
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https://hal.science/hal-01930167/file/article.pdf BibTex
titre
Single-Cell-Based Analysis Highlights a Surge in Cell-to-Cell Molecular Variability Preceding Irreversible Commitment in a Differentiation Process
auteur
Angélique Richard, Loïs Boullu, Ulysse Herbach, Arnaud Arnaud, Valérie Morin, Elodie Vallin, Anissa Guillemin, Nan Papili Gao, Rudiyanto Gunawan, Jérémie Cosette, Ophélie Arnaud, Jean-Jacques Kupiec, Thibault Espinasse, Sandrine Gonin-Giraud, Olivier Gandrillon, Sarah Teichmann
article
PLoS Biology, 2016, 14 (12), ⟨10.1371/journal.pbio.1002585⟩
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titre
Subgraph-based filterbanks for graph signals
auteur
Nicolas Tremblay, Pierre Borgnat
article
IEEE Transactions on Signal Processing, 2016, 64, pp.3827-3840. ⟨10.1109/tsp.2016.2544747⟩
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https://hal.science/hal-01243889/file/CoSub_Filterbanks_paper.pdf BibTex
titre
Active colloids segmentation and tracking
auteur
Xiaofang Wang, Boyang Gao, Simon Masnou, Liming Chen, Isaac Theurkauff, Cécile Cottin-Bizonne, Yuqian Zhao, Frank Shih
article
Pattern Recognition, 2016, 60, pp.177-188. ⟨10.1016/j.patcog.2016.04.022⟩
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BibTex
titre
Variable Clustering in High-Dimensional Linear Regression: The R Package clere
auteur
Loïc Yengo, Julien Jacques, Christophe Biernacki, Mickael Canouil
article
The R Journal, 2016, 8 (1), pp.92-106. ⟨10.32614/RJ-2016-006⟩
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https://hal.science/hal-00940929/file/Yengo_et_al_2014_manuscript.pdf BibTex
titre
Muscular Movement Model-Based Automatic 3D/4D Facial Expression Recognition
auteur
Qingkai Zhen, Di Huang, Yunhong Wang, Liming Chen
article
IEEE Transactions on Multimedia, 2016, 18 (7), pp.1438-1450. ⟨10.1109/TMM.2016.2557063⟩
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Conference papers

titre
Estimation non paramétrique optimale du taux de saut d'un processus markovien déterministe par morceaux
auteur
Romain Azaïs, Aurélie Muller-Gueudin
article
48èmes journées de Statistique de la SFDS, Montpellier, May 2016, Montpellier, France
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https://hal.science/hal-01539139/file/gabarit_text_long.pdf BibTex
titre
Unsupervised Interpretable Pattern Discovery in Time Series Using Autoencoders
auteur
Kevin Bascol, Rémi Emonet, Elisa Fromont, Jean-Marc Odobez
article
The joint IAPR International Workshops on Structural and Syntactic Pattern Recognition (SSPR 2016), Nov 2016, Merida, Mexico
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https://hal.science/hal-01374576/file/sspr_kevin16.pdf BibTex
titre
Model-based co-clustering for functional data
auteur
Yosra Ben Slimen, Sylvain Allio, Julien Jacques
article
48èmes Journées de Statistique organisée par la Société Française de Statistique, 2016, Montpellier, France
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https://hal.science/hal-01383936/file/Functional-coclust.pdf BibTex
titre
Model-based co-clustering for functional data
auteur
Yosra Ben Slimen, Sylvain Allio, Julien Jacques
article
24th International Conference on Computational Statistics, Aug 2016, Oviedo, Spain
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https://hal.science/hal-01383920/file/Functional-coclust.pdf BibTex
titre
DANCer: Dynamic Attributed Network with Community Structure Generator
auteur
Oualid Benyahia, Christine Largeron, Baptiste Jeudy, Osmar R Zaïane
article
European Conference on Machine Learning and Principles and Practice of Knowledge Discovery in Databases, Sep 2016, Riva del Garda, Italy. pp.41 - 44, ⟨10.1007/978-3-319-46131-1_9⟩
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https://auf.hal.science/hal-01377321/file/DANCER_cr2.pdf BibTex
titre
Polar Sine Based Siamese Neural Network for Gesture Recognition
auteur
Samuel Berlemont, Grégoire Lefebvre, Stefan Duffner, Christophe Garcia
article
International Conference on Artificial Neural Networks, Sep 2016, Barcelona, Spain. ⟨10.1007/978-3-319-44781-0_48⟩
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https://hal.science/hal-01369302/file/icann2016.pdf BibTex
titre
Le modèle DFM pour une analyse comparative des systèmes de vélos en libre service
auteur
Charles Bouveyron, Etienne Côme, Julien Jacques
article
48èmes Journées de Statistique organisée par la Société Française de Statistique, 2016, Montpellier, France
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https://hal.science/hal-01383938/file/gabarit_text_long.pdf BibTex
titre
Recherche efficace de motifs fréquents dans des grilles
auteur
Romain Deville, Elisa Fromont, Baptiste Jeudy, Christine Solnon
article
RFIA 2016, Jun 2016, Clermont Ferrand, France
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https://hal.science/hal-01325043/file/rfia-french.pdf BibTex
titre
GriMa: a Grid Mining Algorithm for Bag-of-Grid-Based Classification
auteur
Romain Deville, Elisa Fromont, Baptiste Jeudy, Christine Solnon
article
The joint IAPR International Workshops on Structural and Syntactic Pattern Recognition (SSPR 2016) and Statistical Techniques in Pattern Recognition (SPR 2016), Nov 2016, Merida, Mexico. pp.132-142
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https://hal.science/hal-01376019/file/sspr2016.pdf BibTex
titre
Semantic Segmentation via Multi-task, Multi-domain Learning
auteur
Damien Fourure, Rémi Emonet, Elisa Fromont, Damien Muselet, Alain Trémeau, Christian Wolf
article
S+SSPR 2016 The joint IAPR International Workshops on Structural and Syntactic Pattern Recognition (SSPR 2016) and Statistical Techniques in Pattern Recognition (SPR 2016) , Nov 2016, Merida, Mexico
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https://hal.science/hal-01376998/file/Semantic_Segmentation_via_Multi-task_Multi-domain_Learning.pdf BibTex
titre
Mixed Pooling Neural Networks for Color Constancy
auteur
Damien Fourure, Rémi Emonet, Elisa Fromont, Damien Muselet, Alain Trémeau, Christian Wolf
article
IEEE International Conference on Image Processing, Sep 2016, Phoenix, United States
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https://hal.science/hal-01314066/file/camera_ready.pdf BibTex
titre
Segmentation de scènes extérieures à partir d'ensembles d'étiquettes à granularité et sémantique variables
auteur
Damien Fourure, Rémi Emonet, Elisa Fromont, Damien Muselet, Alain Tremeau, Christian Wolf
article
RFIA 2016, Jun 2016, Clermont Ferrand, France
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https://hal.science/hal-01318461/file/Segmentation_scenes_exterieures_partir_ensembles_etiquettes_granularite_semantique_variables.pdf BibTex
titre
Maximin Action Identification: A New Bandit Framework for Games
auteur
Aurélien Garivier, Emilie Kaufmann, Wouter M. Koolen
article
29th Annual Conference on Learning Theory (COLT), Jun 2016, New-York, United States
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https://hal.science/hal-01273842/file/garivier16b.pdf BibTex
titre
On Explore-Then-Commit Strategies
auteur
Aurélien Garivier, Emilie Kaufmann, Tor Lattimore
article
NIPS, Dec 2016, Barcelona, Spain
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https://hal.science/hal-01322906/file/nips_final.pdf BibTex
titre
Optimal Best Arm Identification with Fixed Confidence
auteur
Aurélien Garivier, Emilie Kaufmann
article
29th Annual Conference on Learning Theory (COLT), Jun 2016, New York, United States
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https://hal.science/hal-01273838/file/MDLBAI.pdf BibTex
titre
A New PAC-Bayesian Perspective on Domain Adaptation
auteur
Pascal Germain, Amaury Habrard, François Laviolette, Emilie Morvant
article
33rd International Conference on Machine Learning (ICML 2016), Jun 2016, New York, NY, United States
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https://hal.science/hal-01307045/file/dalc_icml2016.pdf BibTex
titre
Localization bounds for the graph translation
auteur
Benjamin Girault, Paulo Gonçalves, Shrikanth Narayanan, Antonio Ortega
article
IEEE Global Conference on Signal and Information Processing, Dec 2016, Washington DC, United States. pp.331-335, ⟨10.1109/GlobalSIP.2016.7905858⟩
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https://inria.hal.science/hal-01368817/file/global-sip-2016.pdf BibTex
titre
Combined effect of temperature and ammonia on the freshwater crustacean Gammarus pulex
auteur
Youn Henry, Hervé Colinet, Christophe Piscart, S. Charles
article
SETAC Europe 26th Annual Meeting, May 2016, Nantes, France
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BibTex
titre
A Novel Geometric Facial Representation based on Multi-Scale Extended Local Binary Patterns
auteur
Di Huang, Mohsen Ardabilian, Yunhong Wang, Liming Chen
article
IEEE International Conference on Automatic Face and Gesture Recognition (FG), Mar 2016, Santa Barbara, CA, United States. pp.1-7, ⟨10.1109/FG.2011.5771323⟩
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BibTex
titre
Model-Based Co-clustering for Ordinal Data
auteur
Julien Jacques, Christophe Biernacki
article
Working Group on Model-Based Clustering Summer Session, Jul 2016, Paris, France
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BibTex
titre
Co-clustering for hyperspectral images.
auteur
Julien Jacques, Cyril Ruckebusch
article
6th International Conference in Spectral Imaging, Jul 2016, Chamonix, France
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https://hal.science/hal-01383918/file/IASIM16Coclustering.pdf BibTex
titre
Model-based co-clustering for ordinal data
auteur
Julien Jacques, Christophe Biernacki
article
48èmes Journées de Statistique organisée par la Société Française de Statistique, 2016, Montpellier, France
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https://hal.science/hal-01383927/file/BOScoclust.pdf BibTex
titre
From bioaccumulation to ecotoxicological effects:modelling Gammarus life cycle to predict and assess impacts of contaminants on populations of a sentinel species for environmental monitoring
auteur
C. Lopes, S. Charles, Marc Babut, Arnaud Chaumot, Olivier Geffard
article
Colloque 2016 de la Société Française d'Ecotoxicologie Fondamentale et Appliquée, Jun 2016, Reims, France. pp.56
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BibTex
titre
Bornes en Généralisation à Convergence Rapide pour le Transfert d'Hypothèses en Apprentissage de Métriques
auteur
Michaël Perrot, Amaury Habrard
article
Conférence francophone sur l'Apprentissage Automatique, Jul 2016, Marseille, France
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BibTex
titre
Mapping Estimation for Discrete Optimal Transport
auteur
Michaël Perrot, Nicolas Courty, Rémi Flamary, Amaury Habrard
article
Neural Information Processing System, Dec 2016, Barcelone, Spain
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BibTex
titre
Large Scale Semi-Supervised Object Detection Using Visual and Semantic Knowledge Transfer
auteur
Yuxing Tang, Josiah Wang, Boyang Gao, Emmanuel Dellandréa, Robert Gaizauskas, Liming Chen
article
The IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition (CVPR 2016), Jun 2016, Las Vegas, NV, United States. pp.2119 - 2128, ⟨10.1109/CVPR.2016.233⟩
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https://hal.science/hal-01488579/file/egpaper_for_review.pdf BibTex
titre
Accelerated spectral clustering using graph filtering of random signals
auteur
Nicolas Tremblay, Gilles Puy, Pierre Borgnat, Rémi Gribonval, Pierre Vandergheynst
article
41st IEEE International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing (ICASSP 2016), Mar 2016, Shanghai, China
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https://hal.science/hal-01243682/file/ICASSP_2016_lap%20%281%29.pdf BibTex
titre
Metric Learning as Convex Combinations of Local Models with Generalization Guarantees
auteur
Valentina Zantedeschi, Rémi Emonet, Marc Sebban
article
CVPR2016, Jun 2016, Las Vegas, United States
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https://hal.science/hal-01323567/file/c2lm_site.pdf BibTex
titre
beta-risk: a New Surrogate Risk for Learning from Weakly Labeled Data
auteur
Valentina Zantedeschi, Rémi Emonet, Marc Sebban
article
NIPS 2016, Dec 2016, Barcelona, Spain
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https://hal.science/hal-01359298/file/nips_site.pdf BibTex
titre
Apprentissage de Combinaisons Convexes de Métriques Locales avec Garanties de Généralisation
auteur
Valentina Zantedeschi, Rémi Emonet, Marc Sebban
article
CAp2016, Jul 2016, Marseille, France
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Poster communications

titre
Lossy compression of unordered rooted trees
auteur
Romain Azaïs, Jean-Baptiste Durand, Christophe Godin
article
DCC 2016 - Data Compression Conference, Mar 2016, Snowbird, Utah, United States. ⟨10.1109/DCC.2016.73⟩
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https://inria.hal.science/hal-01394707/file/dcc2016poster.pdf https://inria.hal.science/hal-01394707/file/dcc2016abstract.pdf BibTex
titre
Modèle markovien déterministe par morceaux caché pour la propagation de fissure
auteur
Florine Greciet, Romain Azaïs, Anne Gegout-Petit, Maeva Biret
article
Mathématiques, oxygène du numérique, Oct 2016, Paris, France
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https://hal.science/hal-01398288/file/poster_these.pdf BibTex
titre
Ecophysiological responses of Gammarus pulex to the combined effects of temperature and ammonia
auteur
Youn Henry, Christophe Piscart, Hervé Colinet, Sandrine Charles
article
26th Annual Meeting SETAC Europe, May 2016, Nantes, France
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titre
Combined effect of temperature and ammonia on the freshwater crustacean Gammarus pulex
auteur
Youn Henry, Hervé Colinet, Christophe Piscart, Sandrine Charles
article
SETAC Europe 26th Annual Meeting, May 2016, Nantes, France
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BibTex

Reports

titre
Report on CIMI Thematic Trimester: Machine Learning
auteur
Stergos Afantenos, Nicolas Couellan, Aurélien Garivier, Sébastien Gerchinovitz, Jean-Michel Loubes, François Malgouyres, Josiane Mothe, Sandrine Mouysset, Edouard Pauwels, Mathieu Serrurier, Tim van de Cruys
article
[Rapport de recherche] IRIT : Institut de Recherche en Informatique de Toulouse. 2016
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titre
PAC-Bayesian Theorems for Domain Adaptation with Specialization to Linear Classifiers
auteur
Pascal Germain, Amaury Habrard, François Laviolette, Emilie Morvant
article
[Research Report] Université Jean Monnet, Saint-Étienne (42); Département d'Informatique et de Génie Logiciel, Université Laval (Québec); ENS Paris; IST Austria. 2016
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https://hal.science/hal-01134246/file/main_report_PBDA.pdf BibTex
titre
The Gistr Platform
auteur
Sébastien Lerique
article
[Research Report] Centre d'Analyse et de Mathématique Sociales (UMR 8557). 2016
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https://hal.science/hal-01361964/file/whitepaper.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
The semantic drift of quotations in blogspace: a case study in short-term cultural evolution
auteur
Sébastien Lerique, Camille Roth
article
2016
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https://hal.science/hal-01143986/file/brainscopycut.pdf BibTex